В центре внимания отдела Христианского Востока находится изучение различных проблем восточно-христианских общин, средневековой и новой истории Грузии, армяно-грузинских и армяно-византийских взаимоотношений, история Кавказской Албании, кавказского этно-культурного ареала, а также восточно-христианской церкви и межконфессиональных связей.

В отделе Ирана наряду с актуальными вопросами истории, внутренней и внешней политики, аграрных отношений и исламской революции изучаются также разнородные проблемы классической и современной персидской литературы.

В отделе Турции исследуются политическая история Османской империи и Турции, правовое положение национальных меньшинств, Армянский вопрос и геноцид армян, политика великих держав, особенности развития современной Турции, проблемы османизма, пантюркизма, панисламизма, кемализма, неоосманизма и неопантюркизма.

В отделе Арабских стран изучаюся проблемы средневековой, новой и новейшей истории стран Арабского Востока (Египет, Сирия, Ирак, Ливан и др.), национально-освободительных движений, крушения колониального господства и обретения независимости арабскими странами, международных и межарабских отношений, идиологии, ислама и. т.п.

В отделе Древнего Востока изучаются история, этнические, социально-экономические, культурно-лингвистические проблемы государств Междуречья и Малой Азии - Ассирии, Вавилонии, Хеттского царства и других государственных образований, а также эллинизма.

Основными проблемами Отдела являются исследование иноязычных (на персидском, турецком, арабском, грузинском языках) повествовательных и документальных источников об истории Армении, созданных в соседних странах, их перевод на армянский и увеличение источниковедческой базы для всестороннего и целостного исследования истории Армении.

Отдел занимается исследованием вопросов международных и региональных отношений на Ближнем и Среднем Востоке, а также Южном Кавказе. Он также призван отслеживать основные тенденции политики крупных держав в регионе. В сферу деятельности отдела входет также изучения региональных факторов и межгосударственные отношения Республики Армения с сопредельными государствами.